万州区司法局设13个职能科(室)：
（一）政治处承办局党组日常工作；负责机构编制、干部、人事、工资等工作；负责系统内党建工作、群团工作、精神文明建设和职工队伍的思想政治工作；负责表彰先进、专业技术职务的评审工作；负责干部教育培训工作；承办本局有关双拥、统战、计划生育等工作；完成领导交办的其他工作。

（二）办公室

　　负责本局重大政务活动的组织实施和督查督办；负责综合性文件、报告的起草；协助局领导组织机关日常工作，协调各科室间的业务工作；负责政务信息、对外宣传、文秘、档案、信访、统计、目标考核、机要、保密工作和办公自动化建设；负责机关财务管理、国有资产管理、车辆管理及安全、值班、卫生、接待、后勤保障工作；负责区法学会日常工作；承办本局有关招商引资、绿化等工作；完成领导交办的其他工作。

（三）法制宣传科（区委法建办）

履行区委法建办和依法治区办公室的职能，起草法制建设和依法治区规划、年度计划；负责组织、指导、协调、督促、考核法制建设和依法治区工作年度计划的实施；指导、协调区级各行业、各部门、各乡镇街道的依法治理工作；负责法制宣传、普法教育及普法考试工作；负责法制建设和依法治区工作的对外宣传；承办本局有关环境保护、社会治安综合治理、禁种铲毒等工作；完成领导交办的其他工作。

（四）律师工作管理科

组织实施《律师法》及有关律师工作的法规、规章；负责律师机构设立、变更、撤销的申报登记、审查报批及年检工作；负责申报执业律师、实习律师的资格审查、认证及律师执业证、律师助理证注册的申报登记、审查、报批工作；负责监督调查律师事务所和律师违法违纪行为并上报处理；负责律协分会工作，组织律师工作的对外宣传、交流、协作和业务培训；承办本局有关移民帮促、帮乡扶贫等工作；完成领导交办的其他工作。

（五）法律援助工作管理科

负责管理、指导、协调法律援助工作和“148”法律服务专线工作；负责法律援助人员的注册工作；负责各法律服务机构完成援助案件情况的审查工作；负责受理法律援助案件的投诉和违纪查处工作；组织法律援助工作的对外宣传、交流、协作和业务培训；承办本局有关农村劳动力转移等工作；完成领导交办的其他工作。

（六）公证工作管理科

组织实施《公证法》及有关法规、规章；负责公证机构设置、变更、撤销的申报登记、报批工作；负责公证员资格考核的组织工作及公证机构和公证员名录编制的申报登记、审查、报批工作；负责公证质量的监督、检查工作；指导公证机构重大、疑难公证事项的研究处理；完成领导交办的其他工作。

（七）法制科

　　参与国家和地方立法讨论；负责本局规范性文件的审查和备案工作；负责系统内部法制工作，组织实施执法监督检查；负责司法行政应诉和行政赔偿工作；负责全区仲裁机构登记及年检注册的申报登记、审查、报批工作；负责法制理论研究，组织本系统的调查研究工作；承办区人大代表、政协委员对司法行政工作提出的提案、议案；完成领导交办的其他工作。

（八）司法鉴定工作管理科

　　组织实施有关司法鉴定工作的法律、法规和规章制度；管理、指导司法鉴定工作；负责司法鉴定机构和司法鉴定人员资格的审查、报批工作；负责司法鉴定人员的教育、培训工作；负责对司法鉴定机构和司法鉴定人员违反法律和有关规定的行为的调查、上报工作；完成领导交办的其他工作。

（九）基层工作管理科

　　管理、指导基层司法所建设和工作；管理、指导、监督基层法律服务工作；负责基层法律服务机构设立、变更、撤销的审批及年检报批工作；负责基层法律工作者注册、申报登记、审查、报批工作；管理、指导人民调解工作。承办本局有关新农村建设、小城镇建设等工作；完成领导交办的其他工作。

（十）社区矫正工作管理科

　　负责组织实施有关社区矫正工作的法律法规和规章制度；负责组织、指导、管理乡镇街道对刑释解教人员的安置帮教工作；指导社区对被判处管制、被宣告缓刑、被裁定假释、被暂予监外执行和被剥夺政治权利并在社会上服刑的五种罪犯的教育管理工作；完成领导交办的其他工作。

（十一）司法考试工作科

　　负责全国司法考试重庆考区万州考点的组织及考务工作；负责司法考试报名资格的认定和司法资格证书的申报、登记、审查、报批、年度备案工作，负责向法院、检察院、公证、律师机构提供司法考试有关情况，办理与司法考试工作有关的其他事宜；负责法律函授培训和在职干部法律业务岗位培训；完成领导交办的其他工作。

（十二）退休干部管理科

　　负责本局退休干部管理及服务工作；负责组织退休干部的学习和活动；参与全区老干部成员单位的有关活动并承办有关事宜；完成领导交办的其他工作。

（十三）监察审计科

　　承办局纪检组日常工作；负责制定全区司法行政系统廉政建设和监察工作的实施意见、制度和管理办法并监督实施；负责全局党风廉政建设；受理查处局机关及下属单位有关人员违法违纪的案件；负责局机关及下属单位财务预算、决算、财务收支、资产管理等执行财经纪律情况的内部审计工作；主管系统内审计工作；完成领导交办的其他工作。